宇宙联军的战舰朝着虚空母舰发起总攻，蓝色的能量光束如潮水般击中母舰装甲的裂痕，裂痕不断扩大，母舰内部的暗紫色能量开始外泄。“趁现在，我们潜入母舰！”云航将时空武器的核心部件——一块融合了时空之心与星脉核心碎片的晶体，嵌入登陆舰的能量槽，“艾文，你操控登陆舰在母舰外部吸引火力；我带着核心晶体，从母舰的破损处潜入，找到虚空主宰的本体！”
艾文点头，驾驶登陆舰朝着母舰的引擎部位飞去，同时释放时空能量，不断攻击引擎的防护罩。虚空主宰果然被吸引，派出大量虚空精英围攻登陆舰。云航则趁机驾驶小型穿梭机，从装甲裂痕处冲进母舰内部。
母舰内部弥漫着暗紫色的虚空雾霭，能见度不足十米，地面覆盖着滑腻的黑色物质，墙壁上的能量管道不断渗出暗液，发出“滋滋”的腐蚀声。云航打开战甲的探测功能，循着能量反应最强烈的方向前进。沿途的虚空守卫不断袭来，它们体型瘦长，手中的虚空刃能轻易撕裂金属，云航借助时空之力，将守卫逐一冻结后击碎，快速推进。
深入母舰核心区域时，周围的雾霭突然消散，一座巨型平台出现在眼前——平台中央，一道由暗紫色能量凝聚而成的人形身影悬浮在虚空中，周身缠绕着能扭曲时空的黑色乱流，正是虚空主宰的本体。“外来者，你终于来了。”主宰的声音带着冰冷的威压，震得云航的战甲都在微微颤抖，“你以为凭那块小小的晶体，就能打败我？”
云航握紧核心晶体，金色的时空能量在掌心凝聚：“宇宙的命运，不是你能掌控的！”他纵身跃起，朝着主宰发起攻击，时空能量化作利刃，朝着主宰的身影劈去。主宰冷笑一声，抬手一挥，一道黑色的虚空能量波袭来，与时空利刃碰撞。两股能量交织的瞬间，平台剧烈震动，周围的空间开始塌陷。
“你的时空之力，还不够强！”主宰的身影突然分裂成数十道分身，从各个方向朝着云航袭来。云航迅速展开时空护盾，同时释放出大范围的时空波纹，试图冻结分身的动作。但分身的速度极快，不断撞击护盾，护盾的光芒逐渐黯淡。
就在这时，艾文的声音从通讯器传来：“云航！我突破了引擎防护罩，母舰的能量供应正在下降，你趁现在攻击主宰的核心！”云航心中一喜，突然朝着平台边缘跑去。主宰的分身紧追不舍，就在即将追上时，云航突然转身，将核心晶体的能量全部注入地面——金色的时空符文从地面升起，形成一道封印阵，将所有分身困在阵中。
“不可能！”主宰的本体怒吼着，周身的虚空能量暴涨，试图冲破封印阵。云航趁机冲向主宰，将核心晶体狠狠刺入它的能量核心。金色的时空能量瞬间爆发，顺着核心蔓延至主宰的全身，暗紫色的虚空能量不断被吞噬。
“不——！我不甘心！”主宰发出凄厉的嘶吼，身体开始崩溃，化作无数道黑色的能量碎片。但就在这时，碎片突然凝聚成一道小型虚空之门，试图逃离母舰。“想跑？”云航立刻追上前，将剩余的时空能量注入虚空之门，金色的符文覆盖之门，将门彻底封印。
随着主宰的消亡，虚空母舰的能量核心开始爆炸，整个母舰摇摇欲坠。“云航，快撤离！母舰要炸了！”艾文的声音带着焦急。云航立刻冲向穿梭机，在母舰爆炸的前一秒，驾驶穿梭机冲出母舰。
身后，虚空母舰化作一团巨大的火球，周围的虚空生物也随之化为飞灰。宇宙联军的战舰上爆发出阵阵欢呼，各星域的代表纷纷通过通讯器向云航道谢。云航看着舷窗外恢复平静的星空，握紧手中的核心晶体，露出了笑容。
艾文驾驶登陆舰赶来，与穿梭机会合：“我们赢了，宇宙安全了！”云航点头，目光望向远方：“但宇宙这么大，肯定还会有新的挑战。不过只要我们并肩作战，就没有克服不了的困难。”
星尘号与宇宙联军的战舰一同朝着联盟总部飞去。